Le Comté est fabriqué à partir d'un lait partiellement écrémé. Néanmoins, le caractère tyrannique de la chasse aux lipides avait pu, au cours des années passées, générer une méfiance vis-à-vis du fromage et des lipides qu'il contient, soupçonnés de générer le cholestérol.

Heureusement, aujourd'hui, les recherches les plus récentes ont tempéré les ardeurs anti-cholestérol et surtout ont établi que, grâce à son excès de calcium, les lipides du Comté sont saponifiés dans l'intestin et en partie éliminés par les selles
[cf. Jean-Marie BOURRE, les "Bonnes Graisses" et M. Léon GUEGEN, Cahier Nut. Diet.27(5)].